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按下暫停鍵:窺見膜蛋白復(fù)合體組裝瞬間

按下暫停鍵:窺見膜蛋白復(fù)合體組裝瞬間

線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體組裝示意圖。川一工作室供圖

  線粒體是真核細(xì)胞物質(zhì)代謝和能量代謝的主要場所。它就像一個精密設(shè)計的工廠,超過1000種蛋白質(zhì)在流水線上飛快運(yùn)轉(zhuǎn)。蛋白質(zhì)的正確運(yùn)輸、分選和組裝是線粒體正常行使功能的前提。

  多年來,科學(xué)家一直試圖“窺探”這個高精度流水線的奧秘。

  8月27日,《科學(xué)》在線發(fā)表了湖北洪山實驗室、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳改良國家重點(diǎn)實驗室和生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院蛋白質(zhì)科學(xué)研究團(tuán)隊教授殷平課題組的最新成果。他們揭示了線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體(TOM)組裝的分子機(jī)制,窺見了線粒體高精度流水線的“起點(diǎn)”。

  組裝過程高度動態(tài)

  線粒體是細(xì)胞質(zhì)中一個雙層膜結(jié)構(gòu)的細(xì)胞器。“超過1000種線粒體蛋白質(zhì)中,99%都來自細(xì)胞核基因編碼?!币笃礁嬖V《中國科學(xué)報》,細(xì)胞核基因在細(xì)胞質(zhì)中翻譯為蛋白前體,相應(yīng)的蛋白前體來到線粒體外膜,通過線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體進(jìn)入線粒體。

  “線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體就好像一輛運(yùn)輸車?!币笃秸f,這輛“車”是由7個亞基組成的膜蛋白復(fù)合體,包括核心通道Tom40(β桶膜蛋白)和6個跨膜蛋白——調(diào)控蛋白Tom5、Tom6和Tom7,以及受體蛋白Tom20、Tom22和Tom70。

  中南大學(xué)湘雅醫(yī)院教授邱健告訴《中國科學(xué)報》,此前很多科學(xué)家嘗試用生物化學(xué)方法來分析線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體的組成和組裝。但是,線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體的組裝是一個瞬時、多步驟且高度動態(tài)的過程,很難捕捉到組裝瞬態(tài)的結(jié)構(gòu)。

  而且,線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體是蛋白前體進(jìn)入線粒體的門戶,如果降低該復(fù)合體的某個組分,勢必會影響成熟的線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體的功能,從而干擾對其組裝過程的研究。因此,“研究難度很大”。

  已有研究表明,線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體的組裝需要線粒體分選組裝機(jī)器(SAM)協(xié)助。線粒體分選和組裝機(jī)器也是一類蛋白質(zhì)復(fù)合體。但是,線粒體分選組裝機(jī)器如何協(xié)助線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體組裝的分子機(jī)制尚不清楚。

  “按下暫停鍵”

  “我們的方法就是為組裝過程按下了暫停鍵?!币笃秸f。

  從2019年開始,殷平課題組就關(guān)注相關(guān)問題的研究。為了分離相關(guān)組裝中間體,他們首先在人胚胎腎細(xì)胞系統(tǒng)中共表達(dá)酵母線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體的幾個亞基。

  “有趣的是,我們未能獲得線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體的核心?!币笃桨l(fā)現(xiàn),當(dāng)把酵母線粒體外模轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體的“零件”放到人胚胎腎細(xì)胞的線粒體中時,組裝過程停滯了。

  論文共同第一作者、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士王強(qiáng)說,他們另辟蹊徑,利用哺乳動物細(xì)胞重組表達(dá)系統(tǒng)重構(gòu)了該組裝過程,并實現(xiàn)精準(zhǔn)控制,人為為組裝按下“暫停鍵”。該方法使得研究者捕獲了線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體組裝過程的多個中間態(tài),并獲得其蛋白樣品。

  獲得樣品后,他們利用單顆粒冷凍電鏡技術(shù),首次解析了兩個重要中間態(tài)的高分辨三維結(jié)構(gòu),并結(jié)合功能分析闡明了線粒體分選組裝機(jī)器組裝,以及釋放線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體的分子機(jī)制。

  殷平解釋說,把線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體想象成一輛運(yùn)輸車,線粒體分選組裝機(jī)器就像流水線上的“機(jī)械手”,首先裝上車輛“外殼”Tom40,再裝上兩個“輪子”Tom5和Tom6,然后用Tom7這個“扳手”把組裝好的“外殼”和“輪子”從“機(jī)械手”上卸下來。之后它們會進(jìn)行下一個組裝步驟。

  “我們現(xiàn)在搞清楚了線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體是如何在‘流水線’上組裝和釋放的。”殷平說。

  巧思妙想值得借鑒

  “這是一個設(shè)計非常巧妙的實驗,把酵母的一套蛋白質(zhì)折疊機(jī)器放到了人的線粒體里面去,從而發(fā)現(xiàn)了別人捕捉不到的東西,填補(bǔ)了這個領(lǐng)域的空白?!鼻窠≌f。

  殷平認(rèn)為,線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體負(fù)責(zé)把外界蛋白前體運(yùn)到線粒體內(nèi)部的重要工作,弄清楚其組裝過程可以幫助科學(xué)家更好地探究線粒體蛋白的生物發(fā)生,為線粒體疾病治療和作物遺傳改良提供理論基礎(chǔ)。“這項研究的手段和成果有助于為葉綠體蛋白生物發(fā)生機(jī)制研究提供新視角?!?/p>

  此外,殷平告訴記者,將酵母線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體的組件放到哺乳動物線粒體中去組裝的方法,破解了傳統(tǒng)方法無法捕獲瞬態(tài)的難題。

  邱健表示,生命活動中很多過程都是高度動態(tài)的,傳統(tǒng)生物化學(xué)方法很難捕捉到某一個瞬態(tài)?!斑@是一個很好的啟發(fā),其他系統(tǒng)涉及瞬態(tài)過程的類似問題,也許可以通過相似的思路尋找答案。”

  殷平說,下一步他們將完善線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體組裝的全過程。他希望,線粒體外膜轉(zhuǎn)位酶復(fù)合體的組裝過程能為設(shè)計膜蛋白、創(chuàng)制新藥提供有益的理解。

  相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1126/science.abh0704

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