科研項目經費的財務管理分為三個階段：

事前（科研項目申請、預算編制、任務書階段）

事中（科研項目立后會計核算階段）

事后（科研項目結題驗收專項審計階段）

事前

指直接參加項目研究開發(fā)人員支出的工資性費用（可以歸集在勞務費）。

是指在項目研究開發(fā)過程中所必須購置或試制專用儀器設備，對現(xiàn)有儀器設備進行升級改造，以及租賃外單位儀器設備而發(fā)生的費用。專項經費要嚴格控制設備購置費支出（購置設備費、試制設備費、設備改造與租賃費）。在預算編制時應考慮到企業(yè)在申報書中企業(yè)支撐條件是否有相同的設備。

設備費只能調減不能調增。

是指在項目研究開發(fā)過程中所消耗的各種原材料、輔助材料等低值易耗品的采購及運輸、裝卸、整理等費用。在預算編制時一定注意不是生產性所耗用的各種原材料。

材料費可以調增調減。

是指在項目研究開發(fā)過程中支付給外單位（包括課題承擔單位內部獨立經濟核算單位）的檢驗、測試、化驗及加工等費用。如果不是獨立進行經濟核算的單位，不能單獨支測試化驗加工費，但測試化驗加工過程中發(fā)生的相關費用可在相應科目列支。

測試化驗加工費可以調增調減（但要有相應的支撐）。

是指在項目研究開發(fā)過程中相關大型儀器設備、專用科學裝置等運行發(fā)生的可以單獨計量的水、電、氣、燃料消耗費用等。（不能單獨計價一定要有具體分攤明細）

燃料動力費可以調增調減。

是指在項目研究開發(fā)過程中開展科學實驗（試驗）、科學考察、業(yè)務調研、學術交流等所發(fā)生的外埠差旅費、市內交通費用等。

差旅費開支標準按照國家有關規(guī)定執(zhí)行。

是指在項目研究開發(fā)過程中為組織召開的開展學術研討、咨詢以及協(xié)調項目或課題等活動而發(fā)生的會議費用。課題承擔單位應當按照國家有關規(guī)定，嚴格控制會議規(guī)模、會議數(shù)量、會議開支標準和會期。（會議通知、會議預算、會議簽到、發(fā)票）

是指在項目研究開發(fā)過程中支付給課題組成員中沒有工資性收入的相關人員（如在校研究生）和課題組臨時聘用人員等的勞務性費用。在校學生標準：本科800元、研究生1200元（勞務費發(fā)放要有明細清單及相關要素）

勞務費只能調減，不能調增。

是指在項目研究開發(fā)過程中支付給臨時聘請的咨詢專家的費用。專家咨詢費不得支付給參與支撐計劃及其項目、課題管理相關的工作人員。（專家姓名、專業(yè)、單位、身份證號、聯(lián)系方式、金額、專家簽字）

專家咨詢費只能調減，不能調增。

是指在項目研究開發(fā)過程中對使用本單位現(xiàn)有儀器設備及房屋，日常水、電、氣、暖消耗，以及其他有關管理費用的補助支出。管理費按照項目專項經費預算分段超額累退比例法核定。 

間接費用只能調減，不能調增（可以計提，也可以據(jù)實列支）

事中

直接費用和間接費用。

直接費用是指在項目（課題）實施過程（包括研究、中間試驗試制等階段）中發(fā)生的與之直接相關的費用。主要包括：設備費、材料費、測試化驗加工費、燃料動力費、差旅費、會議費、國際合作交流費、出版/文獻/信息傳播/知識產權事務費、勞務費、專家咨詢費、其它費用。

間接費用是指承擔課題任務的單位組織課題任務的過程中發(fā)生的無法在直接費用中列支的相關費用。

事后

在科研項目結題驗收專項審計階段要重點關注以下幾個問題：

1.經費外撥——應當簽訂子任務書（合同）明確任務要求和預算明細；不得擅自調整外撥資金；不得隨意增加減少課題合作單位；不得向預算外單位轉撥專項經費；嚴禁以任何方式變相轉撥經費，如以測試化驗加工費、設備試制費等名義將科研任務外包等；

2.經費支出——直接費用、間接費用支出；專項支出、自籌支出；支出原則，任務目標相關性、政策相符性、經濟合理性。

3.經費支出數(shù)與預算數(shù)存在的差異，是否有預算調整、有情況說明。